[Dock-fans] Dock6.2 installation - possible failures judgment

Ben Keshet keshet1 at umbc.edu
Mon Mar 17 12:19:30 PDT 2008


Hi All,

I installed Dock6.2 and have several 'possible failures' after running 
'make test'.  I inspected the output of 'make check' and most failures 
were insignificant differences in tails of floating point.  However, 
differences in the scores in secondary_conformers.dif and 
secondary_scores.dif(2,4, and 7) seem more significant.  secondary7 
(primary + secondary with minimization) has huge differences in the grid 
and contact scores.
Some of the .dif files are pasted below. I am running dock on a PC with 
cygwin.  I would greatly appreciate if anyone experienced users could 
help me in judging the severity of these failures or suggest how to fix 
them.
Thanks a lot,
Ben

./primary_secondary_score/secondary2_secondary_conformers.mol2.dif
1734c1734
< ########## Contact Score:          -23.
---
 > ########## Contact Score:          -22.
1748c1748
<       8 O1         21.    7.   59. O.2     1  <0>        -0.
---
 >       8 O1         21.    8.   58. O.2     1  <0>        -0.
1754c1754
<      14 H6         22.    9.   58. H       1  <0>         0.
---
 >      14 H6         21.    7.   59. H       1  <0>         0.
1773c1773
< ########## Contact Score:          -22.
---
 > ########## Contact Score:            0.
1780,1793c1780,1793
<       1 C1         23.   11.   58. C.3     1  <0>        -0.
<       2 C2         23.   10.   59. C.2     1  <0>        -0.
<       3 C3         24.   11.   61. C.2     1  <0>        -0.
<       4 C4         23.   10.   62. C.2     1  <0>        -0.
<       5 S1         22.    9.   61. S.3     1  <0>         0.
<       6 C5         22.    9.   60. C.2     1  <0>        -0.
<       7 C6         22.    8.   59. C.2     1  <0>         0.
<       8 O1         21.    8.   58. O.2     1  <0>        -0.
<       9 H1         24.   12.   58. H       1  <0>         0.
<      10 H2         24.   10.   57. H       1  <0>         0.
<      11 H3         22.   11.   58. H       1  <0>         0.
<      12 H4         24.   12.   60. H       1  <0>         0.
<      13 H5         24.   11.   63. H       1  <0>         0.
<      14 H6         21.    7.   59. H       1  <0>         0.
---
 >       1 C1         22.   12.   62. C.3     1  <0>        -0.
 >       2 C2         21.   11.   62. C.2     1  <0>        -0.
 >       3 C3         21.   11.   60. C.2     1  <0>        -0.
 >       4 C4         21.   10.   60. C.2     1  <0>        -0.
 >       5 S1         20.    9.   61. S.3     1  <0>         0.
 >       6 C5         20.   10.   62. C.2     1  <0>        -0.
 >       7 C6         20.   10.   64. C.2     1  <0>         0.
 >       8 O1         19.    9.   64. O.2     1  <0>        -0.
 >       9 H1         23.   13.   62. H       1  <0>         0.
 >      10 H2         21.   13.   63. H       1  <0>         0.
 >      11 H3         22.   12.   63. H       1  <0>         0.
 >      12 H4         22.   11.   60. H       1  <0>         0.
 >      13 H5         21.    9.   59. H       1  <0>         0.
 >      14 H6         20.   11.   64. H       1  <0>         0.

./primary_secondary_score/secondary4_secondary_conformers.mol2.dif
427,428c427,428
< ##########    Grid Score:    744809088.
< ##########           vdw:    744809088.
---
>  ##########    Grid Score:    744808896.
>  ##########           vdw:    744808896.
617,618c617,618
< ##########    Grid Score:    109571360.
< ##########           vdw:    109571360.
---
>  ##########    Grid Score:    109571376.
>  ##########           vdw:    109571376.
1297,1298c1297,1298
< ##########    Grid Score:   1116566784.
< ##########           vdw:   1116566784.
---
>  ##########    Grid Score:   1116566912.
>  ##########           vdw:   1116566912.

./primary_secondary_score/secondary7.dockout.dif
106c106
<  Contact Score:           95.
---
>  Contact Score:           44.
110,112c110,112
<     Grid Score:         5560.
<            vdw:         5561.
<             es:           -0.
---
>     Grid Score:        78999.
>            vdw:        79001.
>             es:           -1.

./primary_secondary_score/secondary7_primary_conformers.mol2.dif
2c2
< ########## Contact Score:           95.
---
>  ########## Contact Score:           44.
9,61c9,61
<       1 C1         22.    9.   56. C.3     1  C1         -0.
<       2 C10        23.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
<       3 C19        24.    8.   57. C.3     1  C1         -0.
<       4 H27        24.    8.   58. H       1  C1          0.
<       5 H26        25.    9.   57. H       1  C1          0.
<       6 H25        24.    8.   56. H       1  C1          0.
<       7 C9         22.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
<       8 C11        21.    9.   58. C.3     1  C1         -0.
<       9 C12        20.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      10 C13        21.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
<      11 C18        22.    9.   61. C.3     1  C1         -0.
<      12 H24        22.    8.   63. H       1  C1          0.
<      13 H23        23.    9.   61. H       1  C1          0.
<      14 H22        22.    8.   61. H       1  C1          0.
<      15 C17        20.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
<      16 C20        20.    9.   63. C.2     1  C1          0.
<      17 C21        18.    9.   63. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        18.    9.   63. H       1  C1          0.
<      19 H29        19.    8.   63. H       1  C1          0.
<      20 H28        18.    9.   62. H       1  C1          0.
<      21 O2         20.    9.   64. O.2     1  C1         -0.
<      22 H21        19.   11.   62. H       1  C1          0.
<      23 C16        21.   11.   63. C.3     1  C1         -0.
<      24 H20        21.   12.   63. H       1  C1          0.
<      25 H19        22.   11.   63. H       1  C1          0.
<      26 C15        22.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
<      27 H18        23.   13.   61. H       1  C1          0.
<      28 H17        23.   11.   62. H       1  C1          0.
<      29 C14        22.   11.   60. C.3     1  C1         -0.
<      30 H16        21.   12.   60. H       1  C1          0.
<      31 C8         23.   11.   59. C.3     1  C1         -0.
<      32 H10        24.   10.   59. H       1  C1          0.
<      33 C7         24.   12.   59. C.3     1  C1         -0.
<      34 H9         23.   12.   58. H       1  C1          0.
<      35 H8         24.   12.   59. H       1  C1          0.
<      36 C6         24.   12.   57. C.3     1  C1         -0.
<      37 H7         25.   13.   57. H       1  C1          0.
<      38 H6         25.   11.   58. H       1  C1          0.
<      39 C5         24.   11.   56. C.2     1  C1         -0.
<      40 C4         24.   11.   55. C.2     1  C1         -0.
<      41 H5         24.   12.   55. H       1  C1          0.
<      42 C3         23.   10.   54. C.2     1  C1          0.
<      43 O1         23.   11.   53. O.2     1  C1         -0.
<      44 C2         23.    9.   54. C.3     1  C1         -0.
<      45 H4         22.    9.   53. H       1  C1          0.
<      46 H3         24.    8.   54. H       1  C1          0.
<      47 H15        20.    8.   60. H       1  C1          0.
<      48 H14        20.   10.   59. H       1  C1          0.
<      49 H13        22.    8.   59. H       1  C1          0.
<      50 H12        21.    8.   58. H       1  C1          0.
<      51 H11        21.   11.   58. H       1  C1          0.
<      52 H2         21.   10.   56. H       1  C1          0.
<      53 H1         22.    8.   56. H       1  C1          0.
---
>       1 C1         20.   12.   56. C.3     1  C1         -0.
>       2 C10        21.   11.   56. C.3     1  C1         -0.
>       3 C19        21.    9.   55. C.3     1  C1         -0.
>       4 H27        21.    9.   56. H       1  C1          0.
>       5 H26        22.    9.   54. H       1  C1          0.
>       6 H25        20.    9.   55. H       1  C1          0.
>       7 C9         22.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>       8 C11        21.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
>       9 C12        21.   10.   60. C.3     1  C1         -0.
>      10 C13        22.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
>      11 C18        22.    7.   59. C.3     1  C1         -0.
>      12 H24        22.    6.   60. H       1  C1          0.
>      13 H23        23.    7.   58. H       1  C1          0.
>      14 H22        21.    7.   59. H       1  C1          0.
>      15 C17        23.    9.   61. C.3     1  C1         -0.
>      16 C20        22.    8.   62. C.2     1  C1          0.
>      17 C21        22.    8.   63. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        22.    8.   64. H       1  C1          0.
>      19 H29        21.    8.   63. H       1  C1          0.
>      20 H28        22.    9.   63. H       1  C1          0.
>      21 O2         23.    6.   62. O.2     1  C1         -0.
>      22 H21        23.    9.   62. H       1  C1          0.
>      23 C16        25.    8.   61. C.3     1  C1         -0.
>      24 H20        25.    9.   61. H       1  C1          0.
>      25 H19        25.    7.   61. H       1  C1          0.
>      26 C15        25.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
>      27 H18        26.    9.   59. H       1  C1          0.
>      28 H17        25.    8.   59. H       1  C1          0.
>      29 C14        24.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
>      30 H16        24.   10.   59. H       1  C1          0.
>      31 C8         23.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>       32 H10        23.    9.   57. H       1  C1          0.
>      33 C7         24.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>      34 H9         24.   11.   57. H       1  C1          0.
>      35 H8         25.   10.   57. H       1  C1          0.
>      36 C6         24.   11.   55. C.3     1  C1         -0.
>      37 H7         25.   11.   55. H       1  C1          0.
>      38 H6         24.   10.   55. H       1  C1          0.
>      39 C5         23.   11.   55. C.2     1  C1         -0.
>      40 C4         23.   12.   54. C.2     1  C1         -0.
>      41 H5         24.   13.   54. H       1  C1          0.
>      42 C3         21.   13.   54. C.2     1  C1          0.
>      43 O1         21.   14.   53. O.2     1  C1         -0.
>      44 C2         20.   12.   55. C.3     1  C1         -0.
>      45 H4         19.   13.   55. H       1  C1          0.
>      46 H3         20.   12.   54. H       1  C1          0.
>      47 H15        20.    9.   60. H       1  C1          0.
>      48 H14        21.   10.   60. H       1  C1          0.
>      49 H13        20.    9.   58. H       1  C1          0.
>      50 H12        20.   10.   58. H       1  C1          0.
>      51 H11        22.   11.   58. H       1  C1          0.
>      52 H2         20.   12.   57. H       1  C1          0.
>      53 H1         19.   11.   56. H       1  C1          0.
122c122
< ########## Contact Score:          110.
---
>  ########## Contact Score:          218.
129,181c129,181
<       1 C1         20.    8.   62. C.3     1  C1         -0.
<       2 C10        22.    9.   62. C.3     1  C1         -0.
<       3 C19        21.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
<       4 H27        21.   11.   61. H       1  C1          0.
<       5 H26        22.   10.   63. H       1  C1          0.
<       6 H25        20.   10.   63. H       1  C1          0.
<       7 C9         22.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<       8 C11        20.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
<       9 C12        20.    9.   58. C.3     1  C1         -0.
<      10 C13        22.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
<      11 C18        22.   11.   58. C.3     1  C1         -0.
<      12 H24        22.   12.   57. H       1  C1          0.
<      13 H23        22.   12.   58. H       1  C1          0.
<      14 H22        21.   12.   58. H       1  C1          0.
<      15 C17        22.    9.   56. C.3     1  C1         -0.
<      16 C20        21.   10.   55. C.2     1  C1          0.
<      17 C21        20.   10.   54. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        20.    9.   53. H       1  C1          0.
<      19 H29        19.   10.   55. H       1  C1          0.
<      20 H28        20.    9.   55. H       1  C1          0.
<      21 O2         22.   11.   54. O.2     1  C1         -0.
<      22 H21        22.    8.   56. H       1  C1          0.
<      23 C16        24.   10.   56. C.3     1  C1         -0.
<      24 H20        24.    9.   55. H       1  C1          0.
<      25 H19        24.   11.   55. H       1  C1          0.
<      26 C15        24.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
<      27 H18        25.    9.   57. H       1  C1          0.
<      28 H17        24.   11.   58. H       1  C1          0.
<      29 C14        23.    9.   58. C.3     1  C1         -0.
<      30 H16        23.    8.   58. H       1  C1          0.
<      31 C8         23.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      32 H10        23.   10.   60. H       1  C1          0.
<      33 C7         24.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      34 H9         24.    8.   60. H       1  C1          0.
<      35 H8         25.    9.   60. H       1  C1          0.
<      36 C6         24.    9.   62. C.3     1  C1         -0.
<      37 H7         25.    8.   62. H       1  C1          0.
<      38 H6         24.   10.   62. H       1  C1          0.
<      39 C5         23.    8.   62. C.2     1  C1         -0.
<      40 C4         23.    7.   63. C.2     1  C1         -0.
<      41 H5         24.    7.   64. H       1  C1          0.
<      42 C3         22.    7.   64. C.2     1  C1          0.
<      43 O1         22.    6.   65. O.2     1  C1         -0.
<      44 C2         20.    8.   64. C.3     1  C1         -0.
<      45 H4         20.    7.   64. H       1  C1          0.
<      46 H3         20.    8.   64. H       1  C1          0.
<      47 H15        20.    9.   57. H       1  C1          0.
<      48 H14        21.    8.   58. H       1  C1          0.
<      49 H13        20.   10.   60. H       1  C1          0.
<      50 H12        20.    9.   60. H       1  C1          0.
<      51 H11        22.    8.   60. H       1  C1          0.
<      52 H2         20.    7.   62. H       1  C1          0.
<      53 H1         19.    8.   62. H       1  C1          0.
---
>       1 C1         22.   10.   63. C.3     1  C1         -0.
>       2 C10        22.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
>       3 C19        23.    9.   61. C.3     1  C1         -0.
>       4 H27        24.    9.   61. H       1  C1          0.
>       5 H26        23.    8.   61. H       1  C1          0.
>       6 H25        24.    9.   62. H       1  C1          0.
>       7 C9         22.   11.   60. C.3     1  C1         -0.
>       8 C11        23.   12.   60. C.3     1  C1         -0.
>       9 C12        23.   13.   59. C.3     1  C1         -0.
>      10 C13        23.   12.   58. C.3     1  C1         -0.
>      11 C18        25.   11.   58. C.3     1  C1         -0.
>      12 H24        25.   12.   57. H       1  C1          0.
>      13 H23        24.   10.   57. H       1  C1          0.
>      14 H22        25.   11.   58. H       1  C1          0.
>      15 C17        23.   13.   57. C.3     1  C1         -0.
>      16 C20        24.   14.   56. C.2     1  C1          0.
>      17 C21        25.   14.   57. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        25.   15.   57. H       1  C1          0.
>      19 H29        26.   14.   57. H       1  C1          0.
>      20 H28        25.   14.   58. H       1  C1          0.
>      21 O2         24.   14.   55. O.2     1  C1         -0.
>      22 H21        22.   14.   57. H       1  C1          0.
>      23 C16        22.   12.   55. C.3     1  C1         -0.
>      24 H20        22.   12.   55. H       1  C1          0.
>      25 H19        23.   12.   55. H       1  C1          0.
>      26 C15        22.   11.   56. C.3     1  C1         -0.
>      27 H18        21.   10.   56. H       1  C1          0.
>      28 H17        23.   10.   56. H       1  C1          0.
>      29 C14        22.   11.   58. C.3     1  C1         -0.
>      30 H16        21.   12.   58. H       1  C1          0.
>      31 C8         22.   10.   59. C.3     1  C1         -0.
>      32 H10        23.    9.   59. H       1  C1          0.
>      33 C7         21.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
>      34 H9         20.   10.   59. H       1  C1          0.
>      35 H8         21.    9.   58. H       1  C1          0.
>      36 C6         21.    8.   60. C.3     1  C1         -0.
>      37 H7         20.    8.   60. H       1  C1          0.
>      38 H6         21.    7.   60. H       1  C1          0.
>      39 C5         21.    9.   61. C.2     1  C1         -0.
>      40 C4         20.    8.   62. C.2     1  C1         -0.
>      41 H5         19.    8.   62. H       1  C1          0.
>       42 C3         20.    9.   63. C.2     1  C1          0.
>      43 O1         19.    8.   64. O.2     1  C1         -0.
>      44 C2         21.    9.   64. C.3     1  C1         -0.
>      45 H4         21.   10.   65. H       1  C1          0.
>      46 H3         22.    9.   64. H       1  C1          0.
>      47 H15        24.   13.   59. H       1  C1          0.
>      48 H14        22.   13.   59. H       1  C1          0.
>      49 H13        24.   11.   60. H       1  C1          0.
>      50 H12        23.   12.   61. H       1  C1          0.
>      51 H11        21.   11.   60. H       1  C1          0.
>      52 H2         21.   11.   63. H       1  C1          0.
>      53 H1         23.   11.   63. H       1  C1          0.
242c242
< ########## Contact Score:          163.
---
>  ########## Contact Score:          225.
249,301c249,301
<       1 C1         22.   12.   63. C.3     1  C1         -0.
<       2 C10        22.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
<       3 C19        24.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
<       4 H27        24.   10.   61. H       1  C1          0.
<       5 H26        24.    9.   62. H       1  C1          0.
<       6 H25        24.   10.   62. H       1  C1          0.
<       7 C9         22.   11.   61. C.3     1  C1         -0.
<       8 C11        22.   12.   60. C.3     1  C1         -0.
<       9 C12        22.   12.   58. C.3     1  C1         -0.
<      10 C13        22.   11.   58. C.3     1  C1         -0.
<      11 C18        23.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
<      12 H24        23.   10.   56. H       1  C1          0.
<      13 H23        23.    9.   57. H       1  C1          0.
<      14 H22        24.   11.   58. H       1  C1          0.
<      15 C17        21.   11.   56. C.3     1  C1         -0.
<      16 C20        22.   12.   55. C.2     1  C1          0.
<      17 C21        23.   13.   55. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        22.   14.   55. H       1  C1          0.
<      19 H29        24.   13.   55. H       1  C1          0.
<      20 H28        23.   13.   56. H       1  C1          0.
<      21 O2         21.   12.   54. O.2     1  C1         -0.
<      22 H21        20.   12.   56. H       1  C1          0.
<      23 C16        21.   10.   56. C.3     1  C1         -0.
<      24 H20        19.   10.   56. H       1  C1          0.
<      25 H19        21.    9.   55. H       1  C1          0.
<      26 C15        21.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
<      27 H18        20.    8.   57. H       1  C1          0.
<      28 H17        22.    8.   57. H       1  C1          0.
<      29 C14        21.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
<      30 H16        20.   10.   58. H       1  C1          0.
<      31 C8         22.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      32 H10        23.    9.   59. H       1  C1          0.
<      33 C7         21.    8.   60. C.3     1  C1         -0.
<      34 H9         20.    9.   60. H       1  C1          0.
<      35 H8         21.    7.   60. H       1  C1          0.
<      36 C6         21.    8.   62. C.3     1  C1         -0.
<      37 H7         20.    7.   62. H       1  C1          0.
<      38 H6         22.    7.   61. H       1  C1          0.
<      39 C5         21.    9.   63. C.2     1  C1         -0.
<      40 C4         21.    9.   64. C.2     1  C1         -0.
<      41 H5         20.    8.   64. H       1  C1          0.
<      42 C3         21.   10.   65. C.2     1  C1          0.
<      43 O1         21.   10.   66. O.2     1  C1         -0.
<      44 C2         22.   11.   64. C.3     1  C1         -0.
<      45 H4         22.   12.   65. H       1  C1          0.
<      46 H3         23.   11.   65. H       1  C1          0.
<      47 H15        22.   13.   58. H       1  C1          0.
<      48 H14        21.   12.   59. H       1  C1          0.
<      49 H13        23.   11.   60. H       1  C1          0.
<      50 H12        22.   13.   60. H       1  C1          0.
<      51 H11        21.   11.   61. H       1  C1          0.
<      52 H2         21.   12.   63. H       1  C1          0.
<      53 H1         23.   12.   63. H       1  C1          0.
---
>       1 C1         23.   10.   56. C.3     1  C1         -0.
>       2 C10        22.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
>       3 C19        21.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
>       4 H27        20.   10.   58. H       1  C1          0.
>       5 H26        20.    8.   57. H       1  C1          0.
>       6 H25        20.   10.   56. H       1  C1          0.
>       7 C9         23.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
>       8 C11        23.   12.   58. C.3     1  C1         -0.
>       9 C12        23.   12.   59. C.3     1  C1         -0.
>      10 C13        23.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
>      11 C18        21.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
>      12 H24        21.   12.   62. H       1  C1          0.
>      13 H23        21.   11.   61. H       1  C1          0.
>      14 H22        21.   12.   60. H       1  C1          0.
>      15 C17        24.   12.   62. C.3     1  C1         -0.
>      16 C20        23.   14.   62. C.2     1  C1          0.
>      17 C21        24.   15.   62. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        24.   15.   63. H       1  C1          0.
>      19 H29        23.   15.   61. H       1  C1          0.
>      20 H28        24.   15.   61. H       1  C1          0.
>      21 O2         22.   14.   63. O.2     1  C1         -0.
>      22 H21        25.   13.   62. H       1  C1          0.
>      23 C16        24.   11.   63. C.3     1  C1         -0.
>      24 H20        25.   11.   63. H       1  C1          0.
>      25 H19        23.   11.   64. H       1  C1          0.
>      26 C15        23.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
>      27 H18        24.    9.   62. H       1  C1          0.
>      28 H17        22.   10.   62. H       1  C1          0.
>      29 C14        23.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
>      30 H16        24.   10.   60. H       1  C1          0.
>      31 C8         23.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
>      32 H10        22.    9.   60. H       1  C1          0.
>      33 C7         23.    8.   60. C.3     1  C1         -0.
>      34 H9         24.    8.   60. H       1  C1          0.
>      35 H8         23.    8.   61. H       1  C1          0.
>      36 C6         23.    7.   59. C.3     1  C1         -0.
>      37 H7         23.    6.   59. H       1  C1          0.
>      38 H6         22.    7.   59. H       1  C1          0.
>      39 C5         23.    8.   57. C.2     1  C1         -0.
>      40 C4         23.    7.   56. C.2     1  C1         -0.
>      41 H5         24.    6.   56. H       1  C1          0.
>      42 C3         23.    7.   55. C.2     1  C1          0.
>      43 O1         24.    7.   54. O.2     1  C1         -0.
>      44 C2         23.    9.   54. C.3     1  C1         -0.
>      45 H4         23.    9.   54. H       1  C1          0.
>      46 H3         22.    9.   54. H       1  C1          0.
>      47 H15        23.   13.   59. H       1  C1          0.
>      48 H14        24.   12.   59. H       1  C1          0.
>      49 H13        22.   12.   58. H       1  C1          0.
>      50 H12        23.   12.   57. H       1  C1          0.
>      51 H11        24.   10.   58. H       1  C1          0.
>       52 H2         24.   10.   56. H       1  C1          0.
>      53 H1         22.   11.   55. H       1  C1          0.
362c362
< ########## Contact Score:          225.
---
>  ########## Contact Score:          286.
385,389c385,389
<      17 C21        24.   15.   62. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        24.   15.   63. H       1  C1          0.
<      19 H29        23.   15.   61. H       1  C1          0.
<      20 H28        24.   15.   61. H       1  C1          0.
<      21 O2         22.   14.   63. O.2     1  C1         -0.
---
>      17 C21        22.   15.   62. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        23.   16.   61. H       1  C1          0.
>      19 H29        21.   15.   62. H       1  C1          0.
>      20 H28        22.   14.   61. H       1  C1          0.
>      21 O2         23.   14.   64. O.2     1  C1         -0.
482c482
< ########## Contact Score:          268.
---
>  ########## Contact Score:          286.
489,541c489,541
<       1 C1         20.   10.   63. C.3     1  C1         -0.
<       2 C10        21.    9.   62. C.3     1  C1         -0.
<       3 C19        22.    8.   63. C.3     1  C1         -0.
<       4 H27        23.    8.   62. H       1  C1          0.
<       5 H26        21.    7.   63. H       1  C1          0.
<       6 H25        22.    8.   64. H       1  C1          0.
<       7 C9         21.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
<       8 C11        23.   11.   61. C.3     1  C1         -0.
<       9 C12        23.   11.   60. C.3     1  C1         -0.
<      10 C13        23.   10.   59. C.3     1  C1         -0.
<      11 C18        24.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
<      12 H24        25.    9.   58. H       1  C1          0.
<      13 H23        24.    8.   59. H       1  C1          0.
<      14 H22        25.    9.   60. H       1  C1          0.
<      15 C17        23.   11.   57. C.3     1  C1         -0.
<      16 C20        25.   11.   57. C.2     1  C1          0.
<      17 C21        25.   13.   57. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        26.   13.   56. H       1  C1          0.
<      19 H29        26.   13.   58. H       1  C1          0.
<      20 H28        24.   13.   57. H       1  C1          0.
<      21 O2         26.   11.   56. O.2     1  C1         -0.
<      22 H21        23.   12.   57. H       1  C1          0.
<      23 C16        23.   10.   56. C.3     1  C1         -0.
<      24 H20        22.   10.   55. H       1  C1          0.
<      25 H19        24.    9.   56. H       1  C1          0.
<      26 C15        22.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
<      27 H18        21.    9.   57. H       1  C1          0.
<      28 H17        22.    8.   57. H       1  C1          0.
<      29 C14        22.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
<      30 H16        21.   10.   58. H       1  C1          0.
<      31 C8         21.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      32 H10        22.    8.   60. H       1  C1          0.
<      33 C7         20.    8.   59. C.3     1  C1         -0.
<      34 H9         19.    9.   59. H       1  C1          0.
<      35 H8         20.    8.   58. H       1  C1          0.
<      36 C6         19.    8.   60. C.3     1  C1         -0.
<      37 H7         18.    7.   60. H       1  C1          0.
<      38 H6         20.    7.   61. H       1  C1          0.
<      39 C5         19.    8.   62. C.2     1  C1         -0.
<      40 C4         18.    8.   62. C.2     1  C1         -0.
<      41 H5         17.    8.   62. H       1  C1          0.
<      42 C3         18.    9.   64. C.2     1  C1          0.
<      43 O1         17.    9.   64. O.2     1  C1         -0.
<      44 C2         20.   10.   64. C.3     1  C1         -0.
<      45 H4         19.   11.   65. H       1  C1          0.
<      46 H3         20.    9.   65. H       1  C1          0.
<      47 H15        24.   12.   60. H       1  C1          0.
<      48 H14        22.   12.   59. H       1  C1          0.
<      49 H13        23.   10.   61. H       1  C1          0.
<      50 H12        22.   11.   62. H       1  C1          0.
<      51 H11        21.   11.   61. H       1  C1          0.
<      52 H2         20.   11.   63. H       1  C1          0.
<      53 H1         21.   11.   64. H       1  C1          0.
---
>       1 C1         23.   10.   56. C.3     1  C1         -0.
>       2 C10        22.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
>       3 C19        21.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
>       4 H27        20.   10.   58. H       1  C1          0.
>       5 H26        20.    8.   57. H       1  C1          0.
>       6 H25        20.   10.   56. H       1  C1          0.
>       7 C9         23.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
>       8 C11        23.   12.   58. C.3     1  C1         -0.
>       9 C12        23.   12.   59. C.3     1  C1         -0.
>      10 C13        23.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
>      11 C18        21.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
>      12 H24        21.   12.   62. H       1  C1          0.
>      13 H23        21.   11.   61. H       1  C1          0.
>      14 H22        21.   12.   60. H       1  C1          0.
>      15 C17        24.   12.   62. C.3     1  C1         -0.
>      16 C20        23.   14.   62. C.2     1  C1          0.
>      17 C21        24.   15.   63. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        24.   15.   64. H       1  C1          0.
>      19 H29        24.   16.   62. H       1  C1          0.
>      20 H28        25.   14.   63. H       1  C1          0.
>      21 O2         22.   14.   62. O.2     1  C1         -0.
>      22 H21        25.   13.   62. H       1  C1          0.
>      23 C16        24.   11.   63. C.3     1  C1         -0.
>      24 H20        25.   11.   63. H       1  C1          0.
>      25 H19        23.   11.   64. H       1  C1          0.
>      26 C15        23.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
>      27 H18        24.    9.   62. H       1  C1          0.
>      28 H17        22.   10.   62. H       1  C1          0.
>      29 C14        23.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
>      30 H16        24.   10.   60. H       1  C1          0.
>      31 C8         23.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
>      32 H10        22.    9.   60. H       1  C1          0.
>      33 C7         23.    8.   60. C.3     1  C1         -0.
>      34 H9         24.    8.   60. H       1  C1          0.
>      35 H8         23.    8.   61. H       1  C1          0.
>      36 C6         23.    7.   59. C.3     1  C1         -0.
>      37 H7         23.    6.   59. H       1  C1          0.
>      38 H6         22.    7.   59. H       1  C1          0.
>      39 C5         23.    8.   57. C.2     1  C1         -0.
>      40 C4         23.    7.   56. C.2     1  C1         -0.
>      41 H5         24.    6.   56. H       1  C1          0.
>      42 C3         23.    7.   55. C.2     1  C1          0.
>      43 O1         24.    7.   54. O.2     1  C1         -0.
>      44 C2         23.    9.   54. C.3     1  C1         -0.
>      45 H4         23.    9.   54. H       1  C1          0.
>      46 H3         22.    9.   54. H       1  C1          0.
>      47 H15        23.   13.   59. H       1  C1          0.
>      48 H14        24.   12.   59. H       1  C1          0.
>      49 H13        22.   12.   58. H       1  C1          0.
>      50 H12        23.   12.   57. H       1  C1          0.
>      51 H11        24.   10.   58. H       1  C1          0.
>      52 H2         24.   10.   56. H       1  C1          0.
>      53 H1         22.   11.   55. H       1  C1          0.
./primary_secondary_score/secondary7_primary_scored.mol2.dif
2c2
< ########## Contact Score:           95.
---
>  ########## Contact Score:           44.
9,61c9,61
<       1 C1         22.    9.   56. C.3     1  C1         -0.
<       2 C10        23.    9.   57. C.3     1  C1         -0.
<       3 C19        24.    8.   57. C.3     1  C1         -0.
<       4 H27        24.    8.   58. H       1  C1          0.
<       5 H26        25.    9.   57. H       1  C1          0.
<       6 H25        24.    8.   56. H       1  C1          0.
<       7 C9         22.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
<       8 C11        21.    9.   58. C.3     1  C1         -0.
<       9 C12        20.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
<      10 C13        21.   10.   61. C.3     1  C1         -0.
<      11 C18        22.    9.   61. C.3     1  C1         -0.
<      12 H24        22.    8.   63. H       1  C1          0.
<      13 H23        23.    9.   61. H       1  C1          0.
<      14 H22        22.    8.   61. H       1  C1          0.
<      15 C17        20.   10.   62. C.3     1  C1         -0.
<      16 C20        20.    9.   63. C.2     1  C1          0.
<      17 C21        18.    9.   63. C.3     1  C1         -0.
<      18 H30        18.    9.   63. H       1  C1          0.
<      19 H29        19.    8.   63. H       1  C1          0.
<      20 H28        18.    9.   62. H       1  C1          0.
<      21 O2         20.    9.   64. O.2     1  C1         -0.
<      22 H21        19.   11.   62. H       1  C1          0.
<      23 C16        21.   11.   63. C.3     1  C1         -0.
<      24 H20        21.   12.   63. H       1  C1          0.
<      25 H19        22.   11.   63. H       1  C1          0.
<      26 C15        22.   12.   61. C.3     1  C1         -0.
<      27 H18        23.   13.   61. H       1  C1          0.
<      28 H17        23.   11.   62. H       1  C1          0.
<      29 C14        22.   11.   60. C.3     1  C1         -0.
<      30 H16        21.   12.   60. H       1  C1          0.
<      31 C8         23.   11.   59. C.3     1  C1         -0.
<      32 H10        24.   10.   59. H       1  C1          0.
<      33 C7         24.   12.   59. C.3     1  C1         -0.
<      34 H9         23.   12.   58. H       1  C1          0.
<      35 H8         24.   12.   59. H       1  C1          0.
<      36 C6         24.   12.   57. C.3     1  C1         -0.
<      37 H7         25.   13.   57. H       1  C1          0.
<      38 H6         25.   11.   58. H       1  C1          0.
<      39 C5         24.   11.   56. C.2     1  C1         -0.
<      40 C4         24.   11.   55. C.2     1  C1         -0.
<      41 H5         24.   12.   55. H       1  C1          0.
<      42 C3         23.   10.   54. C.2     1  C1          0.
<      43 O1         23.   11.   53. O.2     1  C1         -0.
<      44 C2         23.    9.   54. C.3     1  C1         -0.
<      45 H4         22.    9.   53. H       1  C1          0.
<      46 H3         24.    8.   54. H       1  C1          0.
<      47 H15        20.    8.   60. H       1  C1          0.
<      48 H14        20.   10.   59. H       1  C1          0.
<      49 H13        22.    8.   59. H       1  C1          0.
<      50 H12        21.    8.   58. H       1  C1          0.
<      51 H11        21.   11.   58. H       1  C1          0.
<      52 H2         21.   10.   56. H       1  C1          0.
<      53 H1         22.    8.   56. H       1  C1          0.
---
>       1 C1         20.   12.   56. C.3     1  C1         -0.
>       2 C10        21.   11.   56. C.3     1  C1         -0.
>       3 C19        21.    9.   55. C.3     1  C1         -0.
>       4 H27        21.    9.   56. H       1  C1          0.
>       5 H26        22.    9.   54. H       1  C1          0.
>       6 H25        20.    9.   55. H       1  C1          0.
>       7 C9         22.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>       8 C11        21.   10.   58. C.3     1  C1         -0.
>       9 C12        21.   10.   60. C.3     1  C1         -0.
>      10 C13        22.    9.   60. C.3     1  C1         -0.
>      11 C18        22.    7.   59. C.3     1  C1         -0.
>      12 H24        22.    6.   60. H       1  C1          0.
>      13 H23        23.    7.   58. H       1  C1          0.
>      14 H22        21.    7.   59. H       1  C1          0.
>      15 C17        23.    9.   61. C.3     1  C1         -0.
>      16 C20        22.    8.   62. C.2     1  C1          0.
>      17 C21        22.    8.   63. C.3     1  C1         -0.
>      18 H30        22.    8.   64. H       1  C1          0.
>      19 H29        21.    8.   63. H       1  C1          0.
>      20 H28        22.    9.   63. H       1  C1          0.
>      21 O2         23.    6.   62. O.2     1  C1         -0.
>      22 H21        23.    9.   62. H       1  C1          0.
>      23 C16        25.    8.   61. C.3     1  C1         -0.
>      24 H20        25.    9.   61. H       1  C1          0.
>      25 H19        25.    7.   61. H       1  C1          0.
>      26 C15        25.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
>      27 H18        26.    9.   59. H       1  C1          0.
>      28 H17        25.    8.   59. H       1  C1          0.
>      29 C14        24.    9.   59. C.3     1  C1         -0.
>      30 H16        24.   10.   59. H       1  C1          0.
>      31 C8         23.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>      32 H10        23.    9.   57. H       1  C1          0.
>      33 C7         24.   10.   57. C.3     1  C1         -0.
>      34 H9         24.   11.   57. H       1  C1          0.
>      35 H8         25.   10.   57. H       1  C1          0.
>      36 C6         24.   11.   55. C.3     1  C1         -0.
>      37 H7         25.   11.   55. H       1  C1          0.
>      38 H6         24.   10.   55. H       1  C1          0.
>      39 C5         23.   11.   55. C.2     1  C1         -0.
>      40 C4         23.   12.   54. C.2     1  C1         -0.
>      41 H5         24.   13.   54. H       1  C1          0.
>      42 C3         21.   13.   54. C.2     1  C1          0.
>      43 O1         21.   14.   53. O.2     1  C1         -0.
>      44 C2         20.   12.   55. C.3     1  C1         -0.
>      45 H4         19.   13.   55. H       1  C1          0.
>      46 H3         20.   12.   54. H       1  C1          0.
>      47 H15        20.    9.   60. H       1  C1          0.
>      48 H14        21.   10.   60. H       1  C1          0.
>      49 H13        20.    9.   58. H       1  C1          0.
>      50 H12        20.   10.   58. H       1  C1          0.
>      51 H11        22.   11.   58. H       1  C1          0.
>      52 H2         20.   12.   57. H       1  C1          0.
>      53 H1         19.   11.   56. H       1  C1          0.






More information about the Dock-fans mailing list